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膜體系酵母雙雜交篩選載體如何選擇

膜體系酵母雙雜交篩選原理:

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膜體系文庫篩選原理:若文庫蛋白X和誘餌蛋白Y共同轉(zhuǎn)到NMY51菌株中,兩者互作會形成完整的泛素,從而被UBPS識別進(jìn)行剪切,剪切下來的LexA-VP16(人工轉(zhuǎn)錄因子TF),從而激活下游報(bào)告基因。


膜體系誘餌載體如何選擇?

膜體系酵母雙雜交體系中根據(jù)誘餌蛋白質(zhì)定位不同,需要選用不同的載體,以便于誘餌蛋白相連接的Cub-LexA-VP16和文庫蛋白相連的泛素NubG相互作用。

蛋白質(zhì)在細(xì)胞分布類型誘餌載體選擇
N端在胞質(zhì),C端在胞外或者細(xì)胞器腔內(nèi)使用pBT3-N
N端在胞質(zhì),C端在胞質(zhì)

N端在胞外或者細(xì)胞器腔內(nèi),C端在胞質(zhì),且N端有信號肽使用pBT3-SUC(去掉終止密碼子)

N端在胞外,C端在胞質(zhì),且N端無信號肽使用pBT3-STE(去掉起始密碼子和終止密碼子)
N端在胞質(zhì),C端在胞質(zhì)

N端和C端同在胞質(zhì)或胞外建議截?cái)嗪蠓侄魏Y選

核體系自激活嚴(yán)重使用pDHB1(去掉終止密碼子)


具體以pBT3-SUC示例如下:

步驟1:通過https://www.novopro.cn/tools/translate.html 網(wǎng)站使CDS序列翻譯為氨基酸序列,如圖所示:

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步驟2:通https://services.healthtech.dtu.dk/services/TMHMM-2.0/  網(wǎng)站預(yù)測誘餌蛋白有否有跨膜結(jié)構(gòu)域,如圖所示該蛋白具有明顯的跨膜結(jié)構(gòu)域。


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步驟3:通過http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/ 網(wǎng)站預(yù)測誘餌蛋白是否具有明顯的信號肽,如圖所示該蛋白N端存在信號肽。

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步驟4:通過 http://smart.embl-heidelberg.de 網(wǎng)站預(yù)測誘餌蛋白存在的已知結(jié)構(gòu)域,方便當(dāng)該誘餌存在自激活時(shí)使用不同結(jié)構(gòu)域篩庫,如圖所示該蛋白存在結(jié)構(gòu)域。

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綜上所述:該蛋白有擴(kuò)膜結(jié)構(gòu)域,N端有信號肽,建議用pBT3-SUC載體篩膜體系文庫。


膜體系酵母雙雜交篩選步驟:

步驟1:誘餌載體構(gòu)建;步驟2:誘餌載體功能驗(yàn)證;步驟3:自激活及毒性檢測;步驟4:酵母文庫初篩;步驟5:對初篩結(jié)果進(jìn)行復(fù)篩;步驟6:一對一驗(yàn)證;步驟7:點(diǎn)板驗(yàn)證。篩選步驟詳情請聯(lián)系當(dāng)?shù)劁N售或者掃描添加源寶微信號咨詢。

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源寶生物:

建設(shè)有遺傳轉(zhuǎn)化和基因功能研究綜合性服務(wù)平臺,致力于為客戶提供分子生物學(xué)基礎(chǔ)研究、基因編輯、基因功能研究驗(yàn)證、動植物遺傳轉(zhuǎn)化、高通量基因測序分析、分子結(jié)構(gòu)生物學(xué)等相關(guān)科研技術(shù)服務(wù),業(yè)務(wù)范圍覆蓋生命科學(xué)研究、體外診斷、生物醫(yī)藥等業(yè)務(wù)領(lǐng)域。聯(lián)系熱線:025-52299880,歡迎咨詢膜體系酵母雙雜交篩選技術(shù)。


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