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CrY2H-Seq高通量酵母篩選

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服務(wù)詳情


載體改造:

CrY2H-seq體系中BD質(zhì)粒pDBlox和AD質(zhì)粒pADlox在ORF插入物的3 ‘端側(cè)翼含有l(wèi)ox突變位點(diǎn)(lox66和lox71)。在兩個(gè)蛋白發(fā)生互作后,AD和BD質(zhì)粒通過(guò)Cre/lox發(fā)生重組,通過(guò)AD和DB載體上的特異性引物,通過(guò)PCR擴(kuò)增可鑒定融合的ORF產(chǎn)物。

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篩選流程:

   1. Mating法對(duì)雙雜文庫(kù)篩選;

   2. 收集互作酵母單克��;

   3. 提取重組質(zhì)粒;

   4. 利用PCR擴(kuò)增目的片段;

   5. 構(gòu)建測(cè)序文庫(kù)并高通量測(cè)序;

   6. 分析并注釋測(cè)序結(jié)果。

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CrY2H-seq技術(shù)優(yōu)勢(shì):

  • 簡(jiǎn)單的,低成本、高通量,對(duì)文庫(kù)無(wú)特殊要求;

  • 可以構(gòu)建轉(zhuǎn)錄因子之間的互作網(wǎng)絡(luò);

  • 可以病原菌與宿主之間的蛋白互作網(wǎng)絡(luò);

  • 可擴(kuò)展至其他酵母篩選體系統(tǒng)(Y1H和Y3H),為了解細(xì)胞內(nèi)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)過(guò)程提供技術(shù)支持。


應(yīng)用實(shí)例:

  • 鑒定擬南芥轉(zhuǎn)錄因子互作網(wǎng)絡(luò)

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(參考文獻(xiàn):S Trigg et al. / Nature Methods 14(8) 2017 819-830


  • 鑒定病原菌與宿主互作網(wǎng)絡(luò)

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(參考文獻(xiàn):F Yang et al. / Nucleic Acids Research 46(3) 2017 e17



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